Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SQLEQ14534 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SQLEQ14534 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms