Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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