Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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