Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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