Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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