Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B2Q13367 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms