Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP1Q13363 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms