Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRSQ13332 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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PTPRSQ13332 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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PTPRSQ13332 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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PTPRSQ13332 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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PTPRSQ13332 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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PTPRSQ13332 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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PTPRSQ13332 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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PTPRSQ13332 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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PTPRSQ13332 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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