Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms