Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP2Q13309 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms