Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ERCC8Q13216 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ERCC8Q13216 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ERCC8Q13216 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ERCC8Q13216 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ERCC8Q13216 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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