Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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