Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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