Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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