Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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