Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXC1Q12948 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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