Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXF1Q12946 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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