Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP53BP1Q12888 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms