Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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