Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB40BQ12829 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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