Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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