Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF5Q12774 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF5Q12774 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
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