Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 PBP4YDL053C 558 nt1.2□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 GLC7YER133W 939 nt1.2□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YIL161WYIL161W 708 nt1.2□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 CSH1YBR161W 1131 nt1.2□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt1.2□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 LAA1YJL207C 6045 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 PCL2YDL127W 927 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YER107W-AYER107W-A 321 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YIL012WYIL012W 342 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YLR169WYLR169W 354 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 CCL1YPR025C 1182 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YSY6YBR162W-A 198 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 PLC1YPL268W 2610 nt1.19□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 PRK1YIL095W 2433 nt1.18□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YLR053CYLR053C 327 nt1.18□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 FIG1YBR040W 897 nt1.18□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YPR147CYPR147C 915 nt1.18□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YHL012WYHL012W 1482 nt1.18□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 SYH1YPL105C 2550 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 TBS1YBR150C 3285 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 FMP16YDR070C 282 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YER189WYER189W 369 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YGR283CYGR283C 1026 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 ATG10YLL042C 504 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 MRPL24YMR193W 777 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 GAL7YBR018C 1101 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YOR333CYOR333C 417 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 PRM4YPL156C 855 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 TUS1YLR425W 3924 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 MSH3YCR092C 3057 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 CDC25YLR310C 4770 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YDR341CYDR341C 1824 nt1.17□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.16□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YGR130CYGR130C 2451 nt1.15□□□□□ -2.22
RTR2Q12378 YEA4YEL004W 1029 nt1.15□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt1.15□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 TRX1YLR043C 312 nt1.15□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt1.15□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 MCT1YOR221C 1083 nt1.15□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YJR061WYJR061W 2808 nt1.15□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 MNE1YOR350C 1992 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 JJJ2YJL162C 1752 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 MRP49YKL167C 414 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YAL069WYAL069W 315 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 RPB11YOL005C 363 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 BAG7YOR134W 1230 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 MSH5YDL154W 2706 nt1.14□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YGR219WYGR219W 342 nt1.13□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 SHE2YKL130C 741 nt1.13□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 TOA1YOR194C 861 nt1.13□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 PHR1YOR386W 1698 nt1.13□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 ATP16YDL004W 483 nt1.12□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 TEN1YLR010C 483 nt1.12□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 ARC18YLR370C 537 nt1.12□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 ERG29YMR134W 714 nt1.12□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 GIM3YNL153C 390 nt1.12□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 RPL33BYOR234C 324 nt1.12□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 PDS5YMR076C 3834 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 VAM6YDL077C 3150 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 CET1YPL228W 1650 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 TDA10YGR205W 873 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 RPL34BYIL052C 366 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 ALB1YJL122W 528 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 APL1YJR005W 2103 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 SRN2YLR119W 642 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 BET5YML077W 480 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YBL096CYBL096C 309 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 BAS1YKR099W 2436 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 DSE1YER124C 1722 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 PET309YLR067C 2898 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 CDC37YDR168W 1521 nt1.1□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YDL026WYDL026W 312 nt1.1□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 BTT1YDR252W 450 nt1.1□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 RTT102YGR275W 474 nt1.1□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 ATG38YLR211C 681 nt1.1□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YPR117WYPR117W 7470 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 AI3Q0060 1248 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 DIG2YDR480W 972 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YGL165CYGL165C 579 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 FCF2YLR051C 654 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 RPL6BYLR448W 531 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 YML003WYML003W 873 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 snR35snR35 204 nt1.09□□□□□ -2.23
RTR2Q12378 PAF1YBR279W 1338 nt1.09□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 IRR1YIL026C 3453 nt1.09□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 GCD2YGR083C 1956 nt1.08□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YER121WYER121W 345 nt1.08□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 GTR2YGR163W 1026 nt1.08□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 PKR1YMR123W 369 nt1.08□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 NOP15YNL110C 663 nt1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 116.5 ms