Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms