Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNA1Q09470 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms