Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCBP1Q09161 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms