Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms