Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGM3Q08188 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGM3Q08188 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGM3Q08188 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGM3Q08188 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TGM3Q08188 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms