Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms