Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LTBQ06643 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms