Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDSRQ06136 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDSRQ06136 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms