Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms