Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ERCC6Q03468 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERCC6Q03468 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms