Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ID3Q02535 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ID3Q02535 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ID3Q02535 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ID3Q02535 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ID3Q02535 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ID3Q02535 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ID3Q02535 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ID3Q02535 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms