Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG1Q02297 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG1Q02297 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms