Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms