Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSG6Q00889 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms