Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSG4Q00888 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSG4Q00888 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSG4Q00888 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSG4Q00888 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms