Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITPNAQ00169 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms