Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2C1P98194 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms