Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP5P82980 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP5P82980 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP5P82980 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms