Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRB1P82279 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRB1P82279 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRB1P82279 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CRB1P82279 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRB1P82279 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CRB1P82279 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CRB1P82279 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRB1P82279 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRB1P82279 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms