Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms