Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms