Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC5P78333 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC5P78333 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms