Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2P78314 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2P78314 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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