Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL11P62913 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL11P62913 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL11P62913 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms