Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA2P62736 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms