Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms