Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTBP60709 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTBP60709 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms